理事会は総会の元に置かれた執行機関です
理事会は総会において選出される12名以上の理事によって構成される。
理事長の選挙は、総会における投票によって行う。
理事会は互選により、副理事長２名、書記、会計正副各２名を定める。
理事会は毎年度４回以上随時に開催し、常時その任に当たる。
理事会は、理事会で定めた業務を委託し、また緊急事項を処理するために、理事長、副理事長、正書記、正会計からなる常任理事会を設置する。常任理事会の処理事項は、次回理事会に報告しなければならない。
理事会の成立のためには、理事の三分の二以上が出席しなければならない。
理事会の業務の年度は、総会閉会宣言から次の総会閉会宣言までの期間とする。
（第９条）
理事長
小川国光(日本福音自由教会協議会)
副理事長
赤江弘之（日本同盟基督教団）
中台孝雄（日本長老教会）
書記
畑野順一（日本フリーメソジスト教団）
森文彦（日本イエス・キリスト教団）
会計
峯野龍弘（ウエスレアンホーリネス教会連合）
渡辺昌彦（シオン・キリスト教団）
理事
原田憲夫（日本福音キリスト教会連合）
竿代照夫（イムマヌエル綜合伝道団）
栗原義忠（日本ホーリネス教団）
中島一碩（基督兄弟団）
金本悟（日本神の教会連盟）
オブザーバー
レイ・リーフ
ケン・テーラー
大沼孝（キリスト者学生会（KGK））
鴻海誠（いのちのことば社）
神津喜代子（女性委員長）
総主事
具志堅 聖
総務
松下和弘（コイノニア・クリスチャン・チャーチ）
